壓力梯度對于PCR實驗室至關重要，能否保持氣流從污染低的區域向污染高的區域流動，是衡量我們PCR實驗室建設成敗的關鍵，但是實踐中發現保持壓力梯度穩定并非易事。比如濾網堵塞、相鄰房間或其它系統內閥門開度調整、門的啟閉、室外風力風向等都可能引起壓力波動甚至失控。針對這些因素，我們逐個分析對策：

  一、濾網堵塞的影響：機組應有專人負責，濾網定期檢查、清洗，不能只通過調節閥門開度的辦法調整室內壓力，因為濾網堵塞才是根本原因，濾網清洗或者更換之后閥門又要全部調回去，費時費力。

二、相鄰房間或其它系統內閥門開度調整變化的影響：祿米
​實驗室設計建造的PCR基因擴增實驗室都推薦使用VAV變風量閥+房間微壓力傳感器，能有效避免房間、閥門之間的相互干擾與影響，傳感器可探測房間內壓力的瞬時變化，通過PID算法，VAV閥門執行器及時自動調整排風或回風閥門開度，維持設定值。類似人體的免疫力系統，能感知變化并做出調整達到新的平衡。
  三、門啟閉的影響：建議有壓力梯度要求的房間門安裝互鎖(比閉門器效果好)，門按順序打開，上一個門完全關閉之后才能打開下一個，盡量減弱對相鄰房間的影響，確保壓力不會失控。
  四、室外風力風向的影響：當室外風速大于3m/s時，產生的壓力約為5Pa，因此核心操作區如果靠外墻，應考慮與相臨房間壓力梯度是否會因為室外風力的影響而導致壓力失控的情形，建議核心區與相通房間的壓力梯度至少10Pa。